Al igual que la Z1, la Z900RS cuenta con un motor de cuatro cilindros en línea de 948 cc, una configuración de motor que ofrece intrínsecamente un gran equilibrio de potencia y manejabilidad. La puesta a punto se centra en la gama media-baja. Las revoluciones se acumulan de forma comedida, pero muy determinada, dando al piloto una sensación de conexión entre el acelerador y la rueda trasera.