Además de contribuir al aspecto más afilado de la Ninja 400, los delgados faros LED (cada uno con luces bajas y altas, así como una luz LED de posición) son muy visibles y ofrecen una mayor luminosidad. 

El motor de 399 cm3 de la Ninja 400 ofrece un equilibrio entre prestaciones y control. El motor ofrece un mayor rendimiento en todas las revoluciones en comparación con su predecesor, con una buena sensación de potencia. La respuesta suave y predecible contribuye a un carácter de motor fácil de controlar. Gracias a su eficiente diseño, el motor compacto y ligero tiene un tamaño a la altura de los motores de 250cc

La Ninja 400 está equipada con un sofisticado puesto de conducción, con un gran tacómetro analógico flanqueado por luces de advertencia en un lado, y un indicador de posición de la marcha y una pantalla LCD multifunción en el otro.

Con un diámetro de 310 mm (el mismo tamaño de disco utilizado en la Ninja ZZR1400), el disco delantero semiflotante de la Ninja 400 ofrece una potencia de frenado segura. Un nuevo y rígido cilindro maestro de freno delantero ayuda a eliminar el recorrido ineficaz (al ralentí), contribuyendo a la controlabilidad, mientras que las dimensiones y el material de los latiguillos de freno cuidadosamente seleccionados contribuyen al tacto de los frenos. Cuenta con la última unidad ABS de Nissin, la más compacta y ligera disponible.

El triángulo de conducción relajado se adapta a una amplia gama de tamaños de pilotos y situaciones de conducción. En comparación con otros modelos (cuya posición de conducción un tanto extrema compromete el confort), la posición elevada del manillar y la posición ligeramente adelantada de los estribos ponen al piloto en condiciones de controlar la moto al tiempo que le ofrecen comodidad.

Mientras que la altura del asiento es de 785 mm, el diseño delgado tanto del asiento como de la parte trasera del motor ofrece a los pilotos una línea sin obstáculos para que sus pies lleguen al suelo.

El aspecto llamativo siempre ha sido el fuerte de los modelos Ninja, independientemente de la cilindrada. La nueva Ninja 400 cuenta con un estilo futurista inspirado en la poderosa Ninja H2. La carrocería de gran volumen atrae la atención y da la impresión de una máquina más grande. Esta impresión se ve reforzada por el diseño de alta calidad y el magnífico ajuste y acabado, que son comparables a las motos de mayor cilindrada.

La Ninja 400 cuenta con un chasis enrejado de diseño similar al de la Ninja H2. Se ha utilizado el avanzado análisis de rigidez dinámica de Kawasaki para garantizar una rigidez óptima con un peso ligero. El motor está montado de forma rígida y se utiliza como elemento de tensión. El diseño del bastidor contribuye contribuye significativamente a la baja masa en vacío de la moto.